单细胞转录组测序

服务介绍

单细胞转录组测序（single cell RNA sequencing，scRNA-seq）指在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一项先进技术，原理是将分离的单个细胞中微量mRNA通过高效扩增后再进行高通量测序。

利用传统转录组测序（Bulk RNA-seq）通常需要研磨和提取生物体、组织或细胞群体中的混合总RNA进行测序，最终得到一群不同的细胞的平均转录组数据。因此传统的Bulk RNA-seq忽略了细胞之间的差异，掩盖了细胞的异质性。单细胞转录组测序极大地革新了转录组学的研究。

单细胞测序应用包括发育生物学、肿瘤学、神经科学、免疫学、疾病机理研究、细胞图谱构建等。



图1 单细胞测序主要流程

技术优势

① 揭示细胞异质性，高分辨率分析：有利于发现细胞亚群和罕见细胞类型，提供细胞功能和状态的详细信息；

② 动态过程研究：适用于研究细胞分化、增殖和肿瘤发生等动态过程中的基因表达变化；

③ 无偏倚的细胞分群：能够更精准地对细胞进行分群，尤其是在免疫学、肿瘤学和遗传学研究中。

七辰优势

① 更全面更深入生信分析：除了基础分析外，额外赠送高级分析，涵盖较高技术含量的细胞分类与注释、组间差异基因分析、差异基因功能富集分析等项目；还可提供更个性化、多元化的定制分析。

② 完备的细胞捕获平台：七辰具备10X Genomics、MobiNova（墨卓）、DNBelab C（华大）、BD Rhapsody共4种不同的单细胞转录组测序技术平台，以及针对性平台选择建议，下单无烦恼！

技术平台对比

单细胞平台	1 0x Genomics	BD Rhapsody	MobiNova（墨卓）	DNBelab C4（华大）
技术原理	微液滴： 液滴全封闭体系，避免串扰	微孔技术： 自然沉降	微流控： 液滴全封闭体系，避免串扰	微流控： 液滴全封闭体系，避免串扰
单芯片样本量	旧Chromium Controller平台： 8通道/芯片； 新Chromium X平台： 16通道/芯片	BD Rhapsody HT Xpress ： 8通道/微孔板	MobiNova-100： 4通道/芯片1-4个样本	Dnbelab C4： 4通道/芯片1-4个样本
样本量/芯片	旧平台：最多8例 新平台：最多16例	老平台： 1-12例 新平台：最多96例	最多4例	最多4例
细胞通量	旧平台：500-10000 cells/通道/样本 新平台：2000-20000 cells/通道/样本	100-40000 cells/通道/样本； 100-60000 cells/通道/样本；	500-20000/通道/样本	5000-30000/通道/样本
多胞率、捕获效率	7-8%/10000 cells、可达65%	2-3%/10000cells、可达80%	5%/10000cells ，可达70%	＜8%/10000cells ， 50%-60%
运行时间	18min	> 40 min	6 min	9 min
微球分离方法	化学消化分离	化学消化分离	发光激发分离	化学消化分离
测序类型	3'转录组、 3'核转录组、 5'VDJ免疫组 ，单细胞ATAC、单细胞表面蛋白、单细胞CRISPER	3'转录组、 5'VDJ免疫组 ， Abseq，单细胞ATAC	3'转录组（植物）、 3'核转录组、 5'VDJ免疫组 （人、小鼠、兔、猴） ，单细胞ChIP-seq，单细胞微生物基因组	3'转录组、 3'核转录组，单细胞ATAC
优势	高通量， 文献发表数量多，认可度高	对细胞温和 ；灵活上样；适用于检测中性粒细胞、干细胞等； 可混样 ，性价比高；高细胞通量；捕获效率高	国产平台 ，拥有更具竞争力的试剂研发和产线；灵活上样 ，不浪费； 运行时间短；性价比高， 数据表现接近10x平台	国产平台，拥有更具竞争力的试剂研发和产线；灵活上样，不浪费；行时间短；性价比高
劣势	价格偏高	市场占有率偏低 ；实验运行时间久，人工成本较高	文献较少	文献较少