转录组

项目介绍

真核有参转录组测序（RNA-seq）采用Illumina测序平台，对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序，与参考基因组比对，既可全面快速分析mRNA序列和丰度信息、又可对基因结构和产生的新转录本进行分析。

应用方向

应用方向

分析发育过程或生长过程时空特异性表达的基因集，描述生长图谱

胁迫研究

研究胁迫环境下的机体响应机制

性状差异

寻找研究对象重要性状或表型

互作关系研究

通过转录水平寻找到关键调节的基因或者代谢通路，研究宿主与寄主之间相互作用关系

七辰优势

1. 样本起始量低

RNA 0.4 μg/建库

2. 周期快、质量好，稳定性高

七辰真核有参转录组测序基于优质的测序平台，通过reads与参考基因组比对，系统全面的对基因进行表达定量和结构分析，获得某个物种在特定条件下的转录信息，实现快速、稳定的测序数据分析及交付。

3. 方案设计专业，质控严格

七辰真核有参转录组测序针对不同的物种和组织部位，采用合适的提取方法；根据不同的需求可提供不同的建库方式；严格要求测序数据质量： Q20＞90％，Q30＞85％。从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都经过科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。

材料选取
RNA样品 ≥0.4μg
文库构建（普通转录组文库/链特异性文库）
上机测序
信息分析

有参转录组	分析内容	解决问题
标准分析	测序数据质量评估	过滤掉低质量数据，保证数据质量
	与参考基因组比对	比对率分析
	基因表达水平分析	分析基本的表达量
	样本相关性分析	分析样本间的相关性大小
	差异基因分析	寻找不同比较组合间的差异基因
	GO/KEGG富集分析	差异基因的GO，KEGG富集分析
	蛋白互作网络分析	差异基因蛋白互作网络的分析
	GSEA分析	基因集富集分析
	WGCNA基因共表达网络分析	分析模块与样本间的相关性，寻找关键模块和hub基因
	可变剪切分析	不同样本间可变剪接事件的差异分析
	SNP/Indel分析	分析变异位点
	新转录本预测	挖掘该物种新的基因或转录本