RNA pulldown
RNA结合蛋白质、高灵敏度、高度特异性、可定量分析
服务特色
七辰生物现提供RNA pull down检测技术服务，使用特异性二抗进行检测，能有效避免抗体重链对结果的信号干扰。并且金开瑞配套自己的质谱平台，能显著提升检测效果。
服务介绍
蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心，如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过WB实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。若待检测目的蛋白明确，选择WB鉴定；若不明确，则可选择质谱鉴定。
服务优势
高特异性：富集与特定RNA序列相互作用的蛋白质，具有高度的特异性
高灵敏度：能够检测低丰度的RNA结合蛋白质，提供高灵敏度的检测能力
广泛适用性：可用于研究各种RNA结合蛋白质，包括转录因子、RNA结合蛋白和翻译调控因子等
可定量分析：通过引入外源标记或荧光标记的RNA探针，可以定量测量RNA与蛋白质的结合强度
联合应用：可与其他技术相结合，如质谱分析、蛋白质组学方法和转录组学方法等，进一步深入研究RNA-蛋白质相互作用的功能和调控网络
服务流程
接受订单及样品
RNA探针标记
与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物
与磁珠结合，洗脱
WB检测或者质谱鉴定
结果交付
客户提供
DRNA序列或者RNA序列构建的质粒（种属）
相同种属的细胞样品
最终交付
基因合成测序报告；
构建含目的基因的质粒、菌液，测序报告；
体外转录模版的sense&antisense引物、模版电泳图；
RNA Pull down蛋白SDS-PAGE银染；
质谱鉴定报告。
服务说明
| 服务名称 | 服务内容 | 交付内容及标准 | 服务周期(工作日) |
|---|---|---|---|
| RNA pull-down （体外转录法） |
基因合成 | 测序报告 | 具体评估 |
| 体外转录sense和antisense模板扩增 | 体外转录2次 | 20 | |
| psense和antisense体外转录并标记为探针 | 探针标记2次(sense、antisense各1次) | ||
| RNA pull-down富集 | 2次 | ||
| SDS-PAGE银染 | 跑胶3个泳道 | 4 | |
| 质谱鉴定互作蛋白 | 质谱鉴定sense、antisense | 10-15 | |
| RNA pull-down （探针法拉蛋白） |
QPCR检测本 底表达 探针设计及合成 (包含对照) |
样本和内参各1次 circRNA探针-biotin/lncRNA探针-biotin/普通对照探针 |
24 |
| RNA探针富集效果检测 | 实验探针和对照探针各1次 | ||
| RNA pull-down富集 | 实验探针和对照探针各1次 | ||
| SDS-PAGE银染 | 跑胶3个泳道 | 4 | |
| 质谱鉴定互作蛋白 | 质谱鉴定对照组和实验组各1次 | 10-15 | |
| RNA pull-down (探针法拉miRNA) |
QPCR检测本 | 样本和内参各1次 | 28 |
| 底表达 | |||
| 探针设计及合成 | circRNA探针-biotin/lncRNA探针-biotin/对照探针 | ||
| RNA探针富集效果检测 | 实验探针和对照探针各1次 | ||
| RNA pull-down富集 互作的蛋白/miRNA | 实验探针和对照探针各1次 | ||
| RNA和miRNA/lncRNA 逆转录及检测 | QPCR检测(input、探针组、对照组) |